Škarnulytė tem um BA em escultura obtido na Brera Academy of Fine Arts em Milão, Itália, e um MA da Tromsø Academy of Contemporary Art, Noruega. Emilija exibiu na Extended Phenotypes, Viafarini, Milão, em 2016; Mirror Matter, Künstlerhaus Bethanien, Berlim, em 2017; e Manifold, Podium, Oslo, em 2017. Os seus filmes foram exibidos no 15th International Venice Architecture Biennale (2016), SIART Bolivia International Art Biennial (2016), entre outros. Škarnulytė foi uma artista-residente no Künstlerhaus Bethanien em 2016. A realizadora também é fundadora e co-directora do Polar Film Lab (com Sarah Schipschack) e membro, juntamente com Tanya Busse, do duo artístico New Mineral Collective.